重点实验室
| 国家级重点实验室（2个） |
| 水下机器人国家级重点实验室 |
| 水声技术国家级重点实验室 |
| 国家级教学基地（1个） |
| 国家工科基础课程电工电子教学基地 |
| 国家大学生校外实践教育基地（3个） |
| 哈尔滨工程大学-中国船舶及海洋工程设计研究院工程实践教育中心 |
| 哈尔滨工程大学-中国船舶重工集团国营第三六八厂工程实践教育中心 |
| 哈尔滨工程大学-中国核工业集团公司工程实践教育中心 |
| 国家级实验教学示范中心（4个） |
| 电工电子实验教学示范中心 |
| 工程训练中心 |
| 物理实验教学示范中心 |
| 船舶与海洋工程实验教学中心 |
| 工业和信息化部教学示范中心（3个） |
| 力学实验教学中心 |
| 声学实验教学中心 |
| 计算机实验教学中心 |
| 教育部科技创新团队（1个） |
| 核动力运行与仿真 |
| 教育部重点实验室及工程研究中心（5个） |
| 超轻材料与表面技术教育部重点实验室 |
| 导航仪器教育部工程研究中心 |
| 船舶控制工程教育部工程研究中心 |
| 船舶动力技术教育部工程研究中心 |
| 纤维集成光学教育部重点实验室 |
| 国家级人才培养模式创新实验区（1个） |
| 大学生文化素质教育人才培养模式创新实验区 |
| 国防重点学科实验室（2个） |
| 核安全与仿真技术国防重点学科实验室 |
| 多体船技术国防重点学科实验室 |
| 省级实验教学示范中心（6个） |
| 力学实验教学中心 |
| 经济管理实验中心 |
| 控制工程实验教学中心 |
| 计算机实验教学中心 |
| 机械工程实验教学中心 |
| 动力与能源工程实验教学中心 |
| 省重点实验室及工程研究中心（5个） |
| 水下智能作业技术装置实验室 |
| 光纤传感科学与技术实验室 |
| 现代制造工程技术研究中心 |
| 船舶科学与技术实验室 |
| 灾害预警与工程防御实验室 |
| 省发改委工程实验室（3个） |
| 船舶与海洋控制工程实验室 |
| 导航仪器工程实验室 |
| 新一代网络信息保障工程实验室 |
| 一级学科国家重点学科（1个） |
| 船舶与海洋工程（下设3个二级学科：船舶与海洋结构物设计制造、水声工程、轮机工程） |
| 二级学科国家重点学科（1个） |
| 导航、制导与控制 |
| 工业和信息化部两化融合类重点学科（1个） |
| 动力工程及工程热物理 |
| 工业和信息化部新兴交叉重点学科（2个） |
| 集成光子信息技术 |
| 海洋信息工程 |
| 工业和信息化部重点专业（4个） |
| 工业设计 |
| 测控技术与仪器 |
| 物联网工程 |
| 信息对抗技术 |
| 教育部专业综合改革试点专业（4个） |
| 船舶与海洋工程 |
| 测控技术与仪器 |
| 电子信息工程 |
| 核化工与核燃料工程 |
| 教育部第一类特色专业建设点（7个） |
| 船舶与海洋工程 |
| 轮机工程 |
| 热能与动力工程 |
| 自动化 |
| 测控技术与仪器 |
| 信息对抗技术 |
| 核工程与核技术 |
| “十一五”国防特色紧缺学科（3个） |
| 核能科学与工程 |
| 核技术及应用 |
| 隐身技术与工程 |
| “十一五”国防特色骨干学科（2个） |
| 船舶与海洋结构物设计制造 |
| 水声工程 |
| “十一五”国防特色主干学科（3个） |
| 轮机工程 |
| 导航、制导与控制 |
| 通信与信息系统 |
| “十一五”国防特色支撑性基础学科（1个） |
| 固体力学 |
| “十一五”国防特色新兴交叉边缘学科（2个） |
| 船舶电磁兼容 |
| 熔体化学与物理 |
| “十一五”国防特色重点专业（1个） |
| 船舶与海洋工程 |
| “十一五”国防特色紧缺专业（6个） |
| 质量与可靠性工程 |
| 保密与信息安全工程 |
| 核反应堆工程 |
| 核技术 |
| 辐射防护与环境工程 |
| 水声工程 |
| “十二五”黑龙江省重点学科（12个） |
| 学科群（1个） |
| 现代舰船与深海工程 |
| 一级学科（11个） |
| 船舶与海洋工程 |
| 控制科学与工程 |
| 信息与通信工程 |
| 机械工程 |
| 光学工程 |
| 管理科学与工程 |
| 核科学与技术 |
| 动力工程及工程热物理 |
| 力学 |
| 计算机科学与技术 |
| 材料科学与工程 |
师资力量
学校现有教职工3160人，教师中有“两院”院士8人，博士生导师331人，享受政府特殊津贴专家105人，国家级有突出贡献中青年专家3人，“长江学者奖励计划”特聘教授、讲座教授5人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者21人。学校是首批入选“卓越工程师教育培养计划”高校，并被教育部、总政治部列入“21世纪人才强军计划”，是海军在东北地区唯一选拔培养后备军官的依托学校。
