学校设有中医学院·中西医结合学院、药学院、医学院·整合医学学院、针灸推拿学院·养生康复学院、护理学院、卫生经济管理学院、人工智能与信息技术学院、养老服务与管理学院、国际教育学院及第一、二、三临床医学院等教学机构，与中国科学院上海药物研究所全面合作，共建“新中药学院”（中药学“4+5”本博连读9年制）。
