| 少年班学院 |
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| 数学科学学院 |
数学与应用数学
信息与计算科学
理科试验班类(华罗庚数学科技英才班)
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| 物理学院 |
量子信息科学
应用物理学
物理学
天文学
光电信息科学与工程
理科试验班类(严济慈物理科技英才班)
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| 化学与材料科学学院 |
化学
材料化学
材料物理
高分子材料与工程
理科试验班类(卢嘉锡化学科技英才班)
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| 工程科学学院 |
理论与应用力学
测控技术与仪器
安全工程
能源与动力工程
机械设计制造及其自动化
工科试验班(钱学森力学科技英才班)
机器人工程
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| 信息科学技术学院 |
通信工程(已停招)
电子信息工程
人工智能
自动化
工科试验班(信息科技英才班)
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| 计算机科学与技术学院 |
计算机科学与技术
软件工程(已停招)
工科试验班(华夏计算机科技英才班)
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| 人工智能与数据科学学院 |
人工智能
数据科学与大数据技术
工科试验班(人工智能科技英才班)
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| 网络空间安全学院 |
信息安全
网络空间安全
工科试验班(王小谟网络空间科技英才班)
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| 微电子学院 |
电子科学与技术
集成电路设计与集成系统
工科试验班(中微集成电路英才班)
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| 软件学院 |
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| 地球和空间科学学院 |
环境科学
行星科学
空间科学与技术
地球化学
地球物理学
大气科学
理科试验班类(赵九章现代地球和空间科技英才班)
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| 生命科学学院 |
生物科学
生物技术
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| 基础医学院 |
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| 临床医学院 |
临床医学
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| 生物医学工程学院 |
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| 管理学院 |
工商管理
统计学
管理科学
信息管理与信息系统(已停招)
金融学
工商管理(创新创业)
管理科学(商务智能)
金融学(智慧金融)
大数据管理与应用
统计学(统计与大数据技术)
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| 公共事务学院 |
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| 人文与社会科学学院 |
考古学
英语
传播学
网络与新媒体
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| 马克思主义学院 |
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| 环境科学与工程系 |
环境科学与工程
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| 核科学技术学院 |
工程物理
应用物理学
核工程与核技术
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| 未来技术学院 |
量子信息科学
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| 科技商学院 |
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| 科学岛分院 |
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| 环境科学与光电技术学院（科教融合学院） |
应用物理学
环境科学
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| 材料科学与工程学院（科教融合学院） |
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| 天文与空间科学学院（科教融合学院） |
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| 纳米技术与纳米仿生学院（科教融合学院） |
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| 应用化学与工程学院（科教融合学院） |
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| 生物医学工程学院（苏州）（科教融合学院） |
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| 能源科学与技术学院（科教融合学院） |
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| 稀土学院（科教融合学院） |
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| 卓越工程师学院 |
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| 环境科学与光电技术学院(科教融合学院) |
应用物理学
环境科学
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| 材料科学与工程学院(科教融合学院) |
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| 天文与空间科学学院(科教融合学院) |
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| 纳米技术与纳米仿生学院(科教融合学院) |
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| 应用化学与工程学院(科教融合学院) |
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| 生物医学工程学院(苏州)(科教融合学院) |
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| 能源科学与技术学院(科教融合学院) |
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| 稀土学院(科教融合学院) |
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| 国家示范性微电子学院 |
电子科学与技术
集成电路设计与集成系统
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| 研究生院科学岛分院 |
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| 材料科学与工程学院 |
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| 天文与空间科学学院 |
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| 中国科学院长春应用化学研究所 |
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| 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 |
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| 中国科学院广州能源研究所 |
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| 中国科学院赣江创新研究院 |
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